MTT:n taloustutkimus tukee politiikkavalmistelua ja päätöksentekoa tuottamalla tietoa erilaisten politiikkaohjauskeinojen vaikuttavuudesta ja tehokkuudesta niin kansallisesti kuin koko EU:ssakin.
Taloustutkimuksen tutkimusteemoina ovat maatila- ja maaseutuyrityksiin, elintarvikemarkkinoihin, maatalous- ja maaseutupolitiikkaan ja luonnonvarojen kestävään käyttöön liittyvät kysymykset.
Lisäksi yksikkö vastaa noin tuhannen maatalousyrityksen FADN / kannattavuuskirjanpitotietojärjestelmästä, johon perustuvat monet yksikön viranomais- ja asiantuntijapalvelut.
Elintarvikeketjuun ja -markkinoihin keskittyvä tutkimus edistää yritysten markkinoille pääsyä. Samalla halutaan lisätä kotimaisten markkinoiden läpinäkyvyyttä ja tehokkuutta osana kansainvälisiä elintarvikemarkkinoita.
Yksikkö selvittää maatalouden, elintarvikesektorin ja ympäristön vuorovaikutusta sekä kotimaassa että EU:n alueella. Tutkimuksen avulla haetaan hyvää kustannustehokkuutta ympäristöohjauskeinoihin.